Το όνομα αυτού του κοκτέιλ προέρχεται από τις κραυγές χαράς των κατοίκων της Κούβας για να γιορτάσουν την απελευθέρωση του νησιού από την Ισπανία μετά από έναν πόλεμο που διεξήχθη μαζί με τις Ηνωμένες Πολιτείες, το Cuba Libre δεν «εφευρέθηκε» πραγματικά σε εκείνη την περίσταση.
Η εύρεση των ριζών αυτού του ροφήματος κρέμας καρύδας δεν είναι εύκολη και υπάρχουν πολλές ιστορίες, η παλαιότερη που χρονολογείται από το 1800, όταν ο Roberto Cofresi, ένας πειρατής δημιούργησε ένα μείγμα από λευκό ρούμι και ανανά για να ανεβάσει τη διάθεση του πληρώματος.
Το κοκτέιλ γεννήθηκε το 1941 στη Νέα Υόρκη σε ένα μπαρ όπου βρέθηκαν τυχαία ο John G. Martin, διανομέας της βότκας Smirnoff που δεν μπορούσε να πουλήσει στις Ηνωμένες Πολιτείες και ο Jack Morgan που προσπαθούσε να λανσάρει την Ginger Beer του. Μαζί δημιούργησαν το Moscow mule